Serbest Fetal DNA testi (cfDNA) olarak da bilinen ‘Anne Kanından Serbest Fetal DNA Testi (NIPT)’ doğum öncesi anöploidi tarama testidir. Anne adayından koldan basit bir kan alımı ile 10. hafta gibi erken bir dönemden itibaren fetal kromozomal anöploidiler için invaziv olmayan tarama yapar.
GENİŞLETİLMİŞ NIPT TARAMASININ AVANTAJLARI NEDİR?
Fetal kromozom anomalileri 3 yaygın trizomi ile sınırlı değildir. 30 yılı aşkın süredir teknik ve teknolojik sınırlamalar nedeniyle trizomi 21, 18 ve 13 için prenatal tanı ve tarama testleri yapılmaktadır.
Serbest Fetal DNA (cfDNA) temelli prenatal test, diğer adıyla invaziv olmayan prenatal test (NIPT) ile 23 kromozom çiftinin tamamına ilişkin kapsamlı bir tarama yapılmaktadır. Bu genişletilmiş NIPT24 testi ile anne adayının karşı karşıya kaldığı riskler daha net belirlenir.
Örnek Hazırlığı
İlk olarak, plazma cfDNA ekstraksiyonu için tam kandan izole edilir.
Ardından, tüm genom ve PCR işlemi içermeyen yöntem ile mevcut tüm cfDNA’yı kullanarak, çok düşük başarısızlık oranıyla testin verimliliği ve güvenilirliği en yüksek düzeye çıkarılır.
Son olarak, benzeri olmayan adaptörler kullanılarak her numune benzersiz bir şekilde barkodlanır ve yeni nesil dizileme aşamasına geçilir.
Sekanslama
Her parçanın uçları, 2X36 bp okumaları kullanılarak sıralanır.
Bu çift uçlu okumalar, bağlamsal olarak her parçanın uzunluğunu sağlayarak (iki eşleştirilmiş okuma arasındaki mesafeyle ölçülür) genoma hizalanır.
Fragman uzunluğu değerlidir, çünkü daha kısa cfDNA fragmanlarının fetus orijinli olması beklenir,.Daha uzun cfDNA fragmanlarının ise köken olarak anne olma olasılığı daha yüksektir.
Analiz ve Raporlama
Dinamik bir eşik, arama yapmak için yeterli bilgi olup olmadığını belirlemek için her örnek için toplanan okumaların kalitesini ve miktarını ayrı ayrı değerlendirir.
Eğer öyleyse, bu okumalar, beklenen dağılımdan sapmaları aramak için kromozomlara göre sıralanır.
Daha kısa parçalara odaklanarak, göreceli fetal sinyalde bir artış olur ve fetal fraksiyon kesmesi olmadan mükemmel sonuçlara izin verir.